Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLBP06746 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms