Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms