Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms