Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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