Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms