Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms