Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms