Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms