Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TRAF6Q9Y4K3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAF6Q9Y4K3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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