Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF1Q9Y4B6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms