Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54L2Q9Y4B4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54L2Q9Y4B4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms