Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms