Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5BQ9UGL1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.7 ms