Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms