Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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