Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms