Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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