Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PARD6AQ9NPB6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms