Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms