Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1Q9BVN2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1Q9BVN2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms