Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms