Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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