Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN18Q99952 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN18Q99952 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN18Q99952 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN18Q99952 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN18Q99952 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN18Q99952 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms