Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ALPK3Q96L96 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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