Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms