Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms