Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms