Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RAB11FIP4Q86YS3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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