Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAL3Q7RTP6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms