Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms