Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms