Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms