Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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MSMPQ1L6U9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MSMPQ1L6U9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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