Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CTF1Q16619 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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