Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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