Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms