Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
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