Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms