Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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