Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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