Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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