Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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