Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms