Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms