Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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