Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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