Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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