Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms