Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms