Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms